菏泽医专心理健康教育中心始建于2009年，隶属于学生工作处，是面向全体学生开展心理健康教育的专门机构。中心以“热心服务、尊重理解、助人自助、促人成长”为宗旨，以提高学生心理素质、促进学生身心健康成长为理念，以规范化、制度化建设为保障，积极有效地开展心理健康教育工作。目前，中心建有预约室、个体心理咨询室、团体心理辅导室等。
中心目前有9名具备国家心理咨询师资格的专兼职教师为学生提供心理咨询服务。每天都有专人值班，为全校学生提供心理咨询、心理测评、个体心理辅导、团体心理辅导等。中心开通网站、QQ、微信、电子邮箱等网上服务，全天候提供网上预约和在线咨询服务。另外，中心每年都以心理健康节为契机，开展多种心理健康教育活动以提升大学生心理素质。
菏泽医专心理健康教育中心一直坚持“以人为本，促进发展，立足教育，重在预防”的工作理念和“面向全体，区分层次，抓住重点，解决难点”的工作思路，秉承“关注我校大学生心理发展，促进我校大学生心理健康”的宗旨，以宣传普及大学生心理健康知识，提升我校大学生心理素质、提升我校大学生心理健康整体工作水平为己任，致力解决大学生的心理困惑，排除其心理压力，帮助学生早日走向成功的彼岸。
菏泽医专心理健康教育中心从学生工作实际出发，本着统筹、协调、指导和服务的原则，经过探索构建了“12345”心理健康教育模式和“五位一体”学生心理健康教育工作格局。
