菏泽医专护理系党总支共辖二个党支部（护理系第一、第二党支部）。目前党总支共有党员103人，其中正式党员28人，预备党员75人。党总支由书记、组织委员、宣传委员、纪检委员4人组成委员会。下设党支部由书记和委员组成支部委员会。
近年来，在学校党委的正确领导下，认真贯彻落实党建工作目标和各项工作制度，重视党员思想建设、组织建设、作风建设、廉政建设、制度建设、群团建设等，积极适应新时代党支部标准化建设要求，努力完成党章赋予的使命和任务，努力建设学习型、服务型、创新型基层党组织。积极推进“不忘初心、牢记使命”主题教育，深入践行《教师职业道德规范》，坚定理想信念，坚守共产党人的精神追求，自觉履行党员义务，自觉弘扬优良作风，着力发挥党支部的战斗堡垒作用，为学校发展保驾护航。
护理系第一党支部注重学生政治思想和意识形态教育，积极开展社会主义核心价值观教育、“四心”教育、师德教育、中华优秀传统文化教育、普法教育等专题教育活动，带领大学生自主创业，筹建菏泽市牡丹区天使健康养护服务中心，成立护理系天使筑梦志愿服务队，组织开展走基层、“三下乡”社会实践活动等志愿服务活动。
党总支根据系部实际情况和党员的岗位特点创新活动载体，以“筑堡垒、创建先进基层党组织，讲党性、提升师德师风水平，抓改革、提高教育教学质量”为主题，推出了“教学示范岗”、“服务示范岗”、“党员示范岗”等，努力把组织建设成为“支部班子好、党员队伍好、服务职工好、工作业绩好、遵守纪律好”的过硬党总支。2016年被山东省卫生计生委直属机关党委评为“两学一做”学习教育示范党支部，同年被山东省卫生计生委直属机关党委授予先进基层党组织，菏泽医专党委授予先进基层党组织。2017年被菏泽市委基层党建学院定为案例教学点。曾被山东省卫生厅评为巾帼文明岗、党员示范岗、山东省高等学校省级教学团队；国家级METS先进考点。获2017年全国职业院校信息化教学大赛二等奖；2016年山东省“第三届山东省创业大赛团队一等奖”；2015、2016年连续两年获山东省职业院校信息化教学大赛二等奖、三等奖；山东省职业院校技能大赛（高职组）“护理技能”大赛团体三等奖；第一届“人卫杯”创新护理综合大赛优秀人文素养奖；第二届全国高校（高职高专）微课教学比赛优秀奖。《南丁格尔志愿服务队志愿活动》被山东省高校工委评为全省高校校园文化建设活动类优秀成果三等奖。
